NARUTO SHIPPUDEN ist die direkte Fortsetzung von Naruto.

Es spielt zwei Jahre nach dem Ende der ersten Serie und folgt Naruto und seinen Freunden, wie sie zu mächtigeren Ninjas werden.

Im Verlauf der Geschichte entdeckt Naruto, dass er ein größeres Schicksal hat, als einfach nur ein Konoha-Ninja zu werden, während er gegen die Akatsuki-Organisation kämpft.